Epitope, hay còn gọi là yếu tố quyết định kháng nguyên[1] (antigenic determinant) là vị trí cấu trúc trên một phân tử kháng nguyên có thể phản ứng với một kiểu cấu trúc hóa học của phân tử kháng thể hoặc phân tử thụ thể,trong máu hoặc trên tế bào miễn dịch. kích thước một phân tử đơn vị epitop có thể nhỏ chỉ bao gồm một vài phân tử đường hoặc như hapten chúng nằm sâu trong hốc của các vị trí kết hợp kháng nguyên. Một kháng nguyên có thể có một hoặc nhiều epitop do có nhiều epitop nên kháng nguyên có thể gây phản ứng chéo giữa các kháng nguyên có cùng 1 epitop hay 1 epitop cũng có thể có 2 kháng thể phản ứng đặc hiệu. song giữa các phản ứng khác nhau đó có thể có ái lực liên kết khác nhau do cấu trúc phân tử không gian các liên kết khác nhau. Thường thì phân tử kháng nguyên càng lớn thì thường càng có nhiều epitop
Epicope là một phần của protein sinh miễn dịch hoàn toàn có thể được mạng lưới hệ thống miễn dịch nhận ra. Các peptit hoàn toàn có thể được nhận ra bởi những thụ thể của tế bào T sau khi một kháng nguyên đơn cử đã được giải quyết và xử lý nội bào, link với tối thiểu một phân tử MHC và được bộc lộ trên mặt phẳng của tế bào trình diện kháng nguyên dưới dạng phức tạp MHC-peptit .
Đa số các epitope có thể coi là các bề mặt ba chiều có thể khớp với các bề mặt Kháng thể
Epicope đề cập đến tiềm năng đơn cử mà một kháng thể riêng không liên quan gì đến nhau link với .Khi một kháng thể link với một protein, nó không link với hàng loạt protein có chiều dài khá đầy đủ. Thay vào đó, nó link với một đoạn của protein đó được gọi là epitope. Nói chung, một epitope có chiều dài khoảng chừng năm hoặc sáu axit amin. Vì vậy, một chuỗi protein có chiều dài khá đầy đủ nổi bật thực sự chứa nhiều biểu mô khác nhau mà những kháng thể hoàn toàn có thể link. Và, so với bất kể trình tự protein nhất định nào, thường thì người ta sẽ thấy rằng nhiều kháng thể duy nhất sẽ nhận ra protein. Mỗi kháng thể này link với một epitope đơn cử nằm trên protein đó .Liên kết giữa kháng thể và epitope xảy ra tại vị trí link kháng nguyên, được gọi là paratope và nằm ở đầu của vùng đổi khác trên kháng thể. Chiếc dù này chỉ có năng lực link với một loại epitope duy nhất. [ 2 ]
Trong nửa đầu thế kỷ 20, một loạt những mày mò khoa học đã lý giải rằng miễn dịch qua trung gian kháng thể là nền tảng của phản ứng miễn dịch đặc hiệu. Kể từ lần tiên phong được sử dụng làm công cụ điều tra và nghiên cứu nhãn miễn dịch vào đầu những năm 1970, công nghệ tiên tiến kháng thể đã được cải tổ rất nhiều và kháng thể đã trở thành công cụ quan trọng cho hầu hết những nghành nghiên cứu và điều tra khoa học sự sống. Nguyên tắc cơ bản của bất kể kỹ thuật hóa miễn dịch nào là một kháng thể đơn cử sẽ tích hợp với kháng nguyên đơn cử của nó để tạo ra phức tạp kháng thể-kháng nguyên độc quyền. Trong những trang tiếp theo, tất cả chúng ta sẽ tranh luận về thực chất của link này và việc sử dụng link can đảm và mạnh mẽ và đơn cử này như một thẻ phân tử để nghiên cứu và điều tra. [ 3 ]
Biểu mô là một phần của kháng nguyên mà mạng lưới hệ thống miễn dịch của vật chủ nhận ra, tạo ra phản ứng miễn dịch so với mầm bệnh xâm nhập. Nó link đặc biệt quan trọng với thụ thể kháng nguyên tương ứng trên tế bào miễn dịch ( ví dụ điển hình như tế bào B ) và link chỉ xảy ra nếu những cấu trúc bổ trợ. Một khi epitope và thụ thể link với nhau trong sự phối hợp giống như câu đố này, việc sản xuất kháng thể sẽ được kích thích. Các kháng thể này được nhắm tiềm năng đơn cử đến những biểu mô link với những thụ thể kháng nguyên. Theo cách này, epitope cũng là vùng của kháng nguyên được phân biệt bởi kháng thể đơn cử, sau đó vô hiệu kháng nguyên khỏi khung hình vật chủ sau khi link với nó. Vùng trên kháng thể link với epitope được gọi là paratope. Nhiều kháng nguyên có một số ít biểu mô riêng không liên quan gì đến nhau trên mặt phẳng của chúng. Mỗi loại biểu mô này hoàn toàn có thể tương tác với những thụ thể kháng nguyên khác nhau trên những tế bào miễn dịch. Huyết thanh của một người được chủng ngừa thường chứa một hỗn hợp những kháng thể hoàn toàn có thể link với những biểu mô khác nhau trên mặt phẳng của kháng nguyên. Các kháng thể nhắm tiềm năng với cùng một epitope hoàn toàn có thể có những năng lực khác nhau để link với nó. Các epitope cũng được coi là yếu tố quyết định hành động kháng nguyên. Nó thường là một loại protein không tự thân. Tuy nhiên, trong trường hợp mắc những bệnh tự miễn dịch, những trình tự trong vật chủ hoàn toàn có thể được mạng lưới hệ thống miễn dịch công nhận là những biểu mô. Các biểu bì thường có chiều dài khoảng chừng năm hoặc sáu axit amin .Nhiều kháng nguyên có nhiều loại biểu mô khác nhau trên mặt phẳng của chúng. Mỗi epitope có năng lực phản ứng với một thụ thể kháng nguyên tế bào B khác nhau. Ngoài ra, huyết thanh của người hoặc động vật hoang dã được miễn dịch thường chứa một hỗn hợp những kháng thể, tổng thể đều có năng lực phối hợp với cùng một kháng nguyên nhưng có những biểu mô khác nhau Open trên mặt phẳng của kháng nguyên. Hơn nữa, những kháng thể link với cùng một epitope thường có những năng lực khác nhau để link với epitope đó .Có thể có hai hoặc nhiều kháng nguyên khác nhau có chung một biểu mô. Trong những trường hợp này, những kháng thể nhắm tiềm năng đến một kháng nguyên hoàn toàn có thể phản ứng với toàn bộ những kháng nguyên khác mang cùng một epitope. Những kháng nguyên như vậy được gọi là những kháng nguyên phản ứng chéo .
Ánh xạ hình tượng tế bào T[sửa|sửa mã nguồn]
https://immumap.com/t-cell-epitope-mapping/
Vị trí nhỏ trên một kháng nguyên mà một kháng thể bổ sung có thể liên kết đặc biệt được gọi là một yếu tố quyết định kháng nguyên hoặc biểu mô. Đây thường là một đến sáu monosaccharide hoặc năm đến tám gốc axit amin trên bề mặt của kháng nguyên. Vì các phân tử kháng nguyên tồn tại trong không gian, nên các epitope được nhận biết bởi kháng thể có thể phụ thuộc vào sự hiện diện của cấu trúc kháng nguyên ba chiều cụ thể (ví dụ, một vị trí duy nhất được hình thành do sự tương tác của hai vòng protein hoặc tiểu đơn vị bản địa). Đây được biết đến như là một biểu tượng cấu trúc. Các epitope cũng có thể tương ứng với một trình tự tuyến tính đơn giản của các axit amin và các epitop như vậy được gọi là các epitop tuyến tính.Phạm vi các vị trí liên kết có thể có trên phân tử đích (kháng nguyên) là rất lớn, với mỗi vị trí liên kết tiềm năng có các đặc tính cấu trúc riêng của nó bắt nguồn từ liên kết cộng hóa trị, liên kết ion, tương tác ưa nước và kỵ nước. Thật vậy, điều này có những phân nhánh quan trọng đối với sự lựa chọn và hoạt động của kháng thể. Để xảy ra tương tác hiệu quả giữa kháng nguyên đích và kháng thể, thì phải có sẵn các epitope để gắn kết.Nếu phân tử đích bị biến tính, ví dụ, thông qua sự cố định, giảm, thay đổi pH hoặc trong quá trình chuẩn bị cho điện di trên gel, thì biểu mô có thể bị thay đổi và điều này có thể ảnh hưởng đến khả năng tương tác với kháng thể của nó. Ví dụ, một số kháng thể không hiệu quả trong Western blotting (WB) nhưng lại thích hợp cho các ứng dụng hóa mô miễn dịch (IHC), bởi vì, trong quy trình IHC, một vị trí kháng nguyên phức tạp có thể được duy trì trong mô, trong khi trong quy trình WB, quy trình chuẩn bị mẫu làm thay đổi cấu trúc protein đủ để phá hủy vị trí kháng nguyên, và do đó loại bỏ liên kết kháng thể.
Có ba loại biểu mô : hình dạng, tuyến tính và không liên tục. Sự phân loại này dựa trên cấu trúc của chúng và sự tương tác của chúng với dây của kháng thể. Các biểu mô tương thích được hình thành trải qua sự tương tác của những gốc axit amin bị ngắt liên kết với nhau. Số lượng những biểu mô cấu trúc không được biết. Các biểu mô tuyến tính không riêng gì được xác lập bởi cấu trúc chính của chúng ( trình tự những axit amin ) mà còn bởi những chất sống sót khác. Các gốc axit amin xa hơn của kháng nguyên cũng như những gốc nằm bên cạnh cấu trúc chính ảnh hưởng tác động đến cấu trúc ba chiều của biểu mô tuyến tính. Các biểu mô liên tục gồm có những phần của protein được link với nhau bằng cách gấp protein chứ không phải gần nhau trong cấu trúc. Lớp epitope này hoàn toàn có thể chứa cả phần cấu trúc và phần tuyến tính. Dữ liệu từ những nghiên cứu và điều tra khác nhau đã phân phối dẫn chứng rằng hầu hết sự kết nối kháng nguyên-kháng thể xảy ra tại những vị trí epitope không liên tục. Các kháng thể bảo vệ ( ví dụ, những kháng thể trong vắc xin ) đặc biệt quan trọng dựa vào điều này. Tế bào T và B phân phối phản ứng miễn dịch học dựa trên trí nhớ đơn cử về mầm bệnh. Các biểu mô tế bào B là một phần của kháng nguyên mà những kháng thể hoặc globulin miễn dịch link với. Các biểu mô tế bào T được tìm thấy trên mặt phẳng của một tế bào trình diện kháng nguyên và được link với những phân tử phức tạp thích hợp mô lớn. Epitopes hoàn toàn có thể phản ứng chéo .
mô tế bào B ( Epiope cell B )[sửa|sửa mã nguồn]
Các biểu mô tế bào B tương tác trực tiếp với mIgs trên mặt phẳng của tế bào B và không cần giải quyết và xử lý kháng nguyên cho những tương tác này. Kết quả là, những thụ thể của tế bào B hoàn toàn có thể link những kháng nguyên trong những cấu trúc bắt đầu của chúng. Đây là nguyên do tại sao những kháng thể được tạo ra chống lại những protein địa phương thường nhận ra ‘ những biểu mô không liên tục ‘, những yếu tố quyết định hành động kháng nguyên gồm có những axit amin cách xa nhau trong trình tự chính nhưng lại gần nhau trong những cấu trúc gấp lại. Các kháng nguyên hoàn toàn có thể gợi ra phản ứng của tế bào B khá phong phú ; chúng hoàn toàn có thể là protein, lipid, cacbohydrat hoặc những phân tử nhỏ ( ví dụ : asenat, trinitrophenol ). Điều này trái ngược với hầu hết những biểu mô tế bào T thường là những đoạn peptit ngắn. Bản chất phong phú của những kháng nguyên tế bào B làm cho việc Dự kiến trước những biểu mô tế bào B rất khó. Tương tự, những kháng thể được tạo ra chống lại những protein bị biến tính hoặc những kháng nguyên peptit tổng hợp thường nhận ra ‘ những biểu mô liên tục ( tuần tự ) ‘ và không hề nhận ra những protein tương ứng trong cấu trúc địa phương của chúng. Liên kết kháng nguyên với mIgs trên tế bào B gây ra một dòng tín hiệu dẫn đến kích hoạt tế bào B. Việc kích hoạt tế bào B hoàn toàn có thể cần hoặc không cần sự trợ giúp của tế bào T. Các kháng nguyên cần sự trợ giúp của tế bào T để kích hoạt tế bào B là những kháng nguyên nhờ vào vào tuyến ức ( phụ thuộc vào vào T ). Các kháng nguyên hoàn toàn có thể kích thích tế bào B mà không cần sự trợ giúp của tế bào T là kháng nguyên không nhờ vào vào tuyến ức ( T-độc lập ). Phần lớn những kháng nguyên protein nhờ vào vào T, trong khi hầu hết những kháng nguyên không nhờ vào T là những phân tử cao phân tử với những yếu tố quyết định hành động kháng nguyên lặp đi lặp lại. Ví dụ về kháng nguyên không nhờ vào T gồm có những loại sản phẩm vi sinh vật như polysaccharid và protein cao phân tử. [ 7 ] Đầu tiên, những kháng nguyên của tế bào B phụ thuộc vào T link với mIgs trên mặt phẳng của tế bào B. Sau khi link, những kháng nguyên này được nội bào hóa bằng quy trình nội bào qua trung gian thụ thể hoặc bằng quy trình chuyển hóa pinocytosis không đặc hiệu. Khi ở trong tế bào, những protein này vẫn nằm trong những ngăn có mụn nước và không bị trộn lẫn với những protein trong tế bào chất. Các protein nội hóa này được giải quyết và xử lý bởi những protease lysosome để giải phóng những đoạn peptit mà sau đó link với những phân tử MHC lớp II. Các phức tạp peptide – MHC này sau đó nổi lên trên mặt phẳng của tế bào B, nơi chúng tương tác với những TCR đơn cử trên mặt phẳng của tế bào trợ giúp T ( tế bào T CD4 ). Tương tác MHC-peptide-TCR dẫn đến giải phóng cytokine từ tế bào T để trực tiếp tăng sinh và trưởng thành tế bào B. Các tế bào B được hoạt hóa ở đầu cuối sẽ biệt hóa thành những tế bào plasma, tế bào này đã lan rộng ra rất nhiều tế bào chất và mạng lưới nội chất thoáng rộng và trọn vẹn dành cho việc sản xuất những kháng thể. Các yếu tố quyết định hành động kháng nguyên ( biểu mô tế bào B ) có tương quan đến link khởi đầu với những thụ thể tế bào B thường không giống với những yếu tố quyết định hành động ( biểu mô tế bào T ) tương tác với MHC và TCR. Tuy nhiên, những biểu mô tế bào B và tế bào T này hoàn toàn có thể được bản địa hóa thành những vùng chồng chéo trên những protein kháng nguyên. [ 8 ]Các kháng nguyên của tế bào B không phụ thuộc vào vào T kích hoạt tế bào B bằng cách link chéo những thụ thể trên mặt phẳng. Nếu không có sự trợ giúp của tế bào T, những tế bào B này không trải qua quy trình quy đổi lớp gen immunoglobulin và do đó những kháng thể được tạo ra đa phần là IgM. trái lại, những phản ứng của kháng thể so với kháng nguyên nhờ vào T thường trưởng thành để chứa một tỷ suất IgG lớn hơn với ái lực cao hơn với kháng nguyên .
Xác định những biểu mô tế bào B là một bước cơ bản để tăng trưởng vắc xin dựa trên biểu mô, kháng thể điều trị và những công cụ chẩn đoán. Các kháng thể dựa trên Epitope hiện là loại dược phẩm sinh học hứa hẹn nhất. Trong thập kỷ trước, việc nghiên cứu và phân tích sâu và phân loại silico của những biểu mô được xác lập bằng thực nghiệm đã kích thích sự tăng trưởng của những thuật toán để Dự kiến hình tượng. Gần đây, nhiều công cụ silico khác nhau được sử dụng trong nỗ lực Dự kiến biểu mô tế bào B dựa trên tài liệu trình tự và / hoặc cấu trúc. Mục tiêu chính của việc xác lập epitope là sửa chữa thay thế một kháng nguyên trong quy trình chủng ngừa, sản xuất kháng thể và chẩn đoán huyết thanh. Việc xác lập đúng mực những biểu mô tế bào B vẫn còn đặt ra những thử thách lớn so với những nhà miễn dịch học. Những tân tiến trong lập map biểu mô tế bào B và Dự kiến thống kê giám sát đã mang lại những hiểu biết phân tử về quy trình nhận ra sinh học và hình thành phức tạp kháng nguyên – kháng thể, hoàn toàn có thể giúp xác định những biểu mô tế bào B đúng chuẩn hơn. Trong bài báo này, chúng tôi đã xem xét một cách tổng lực những chiêu thức thử nghiệm tân tiến để nhận dạng biểu mô tế bào B, cơ sở tài liệu hiện có cho những hình tượng và tài nguyên silico mới và những công cụ Dự kiến có sẵn trực tuyến. Chúng tôi cũng đã kiến thiết xây dựng những xu thế mới trong Dự kiến epitope dựa trên kháng thể. Mục đích của tổng quan này là để tương hỗ những nhà nghiên cứu xác lập những biểu mô tế bào B. [ 9 ]Bằng chứng liên tục được tích góp ủng hộ giả thuyết rằng tổn thương mô trong quy trình phân phối miễn dịch hoàn toàn có thể dẫn đến việc hình thành những tế bào lympho T và / hoặc B tự phản ứng, bất kể độ đặc hiệu của sự xúc phạm bắt đầu. Bài nhìn nhận này sẽ tập trung chuyên sâu hầu hết vào sự lây lan của epitope ở Lever tế bào T. Hiểu được cơ sở tế bào và phân tử của việc biểu mô lây lan trong những bệnh mãn tính khác nhau qua trung gian miễn dịch ở người và những quy mô động vật hoang dã của chúng là rất quan trọng để hiểu chính sách bệnh sinh của những bệnh này và tiềm năng sau cuối là phong cách thiết kế những chiêu thức điều trị đặc hiệu với kháng nguyên. [ 10 ]
[11]mô tế bào T ( Epiope cell T )[sửa|sửa mã nguồn]
Chúng tôi đã xem xét ở đây những nghiên cứu và điều tra sử dụng peptit tổng hợp để nghiên cứu và phân tích một số ít đặc tính của biểu mô tế bào T. Một số Kết luận chung hoàn toàn có thể được rút ra. Đầu tiên, những biểu mô tế bào T thường hoàn toàn có thể được xác lập bằng trình tự tuyến tính của khoảng chừng bảy axit amin. Tuy nhiên, nhận xét rằng việc tăng chiều dài peptit thường dẫn đến tăng hiệu lực thực thi hiện hành kháng nguyên đã gợi ý rằng tính kháng nguyên hoàn toàn có thể nhờ vào đa phần vào năng lực của những peptit gật đầu những cấu trúc thứ cấp thích hợp. Hai quy mô Dự kiến biểu mô tế bào T chỉ dựa trên tài liệu trình tự sơ cấp đã được bàn luận. Các nghiên cứu và điều tra lý sinh về sự link của những peptit với những phân tử Ia đã chỉ ra rằng những peptit kháng nguyên link trực tiếp với Ia ; dẫn chứng cho thấy rằng mối link nhị phân giữa Ia và peptit xảy ra trong trường hợp không có tế bào T đơn cử. Cuối cùng, một giả thuyết để lý giải quan sát rằng những tế bào B và tế bào T thường nhận ra những biểu mô riêng không liên quan gì đến nhau trên những kháng nguyên đa định lượng đã được nghiên cứu và điều tra .MHC-peptit, được gọi là T – biểu mô tế bào. Những cá thể có tối thiểu một phân tử MHC hoàn toàn có thể link một cách khao khát nhất với trình tự axit amin gây dị ứng từ một chất gây dị ứng, đồng thời có dòng tế bào T thích hợp hoàn toàn có thể nhận ra phức tạp MHC-peptit này, được cho là có khuynh hướng di truyền phản ứng dị ứng chống lại chất gây dị ứng đó. Khả năng này hoàn toàn có thể được kiểm tra trong silico bằng cách sử dụng những kỹ thuật thống kê giám sát văn minh dựa trên toán học và thống kê phức tạp. Các nguyên tắc phong cách thiết kế của những kỹ thuật này là khác nhau và do đó Dự kiến của chúng sẽ có sự biến hóa. Các chương trình ứng dụng sẵn có được tăng trưởng trên cơ sở này hoàn toàn có thể tích hợp số lượng ngày càng tăng và độ phức tạp của tài liệu thí nghiệm sẵn có đã được tổ chức triển khai trong cơ sở tài liệu tin học miễn dịch để Dự kiến những biểu mô tế bào T có năng lực gây dị ứng. Tất cả những giải pháp Dự kiến biểu mô tế bào T có tương quan hoàn toàn có thể được truy vấn trực tuyến dưới dạng ứng dụng không lấy phí .[ 12 ]
Liên kết ngoài[sửa|sửa mã nguồn]
https://www.sigmaaldrich.com/EN/en/technical-documents/technical-article/protein-biology/elisa/antigens-epitopes-antibodies
https://immumap.com/t-cell-epitope-mapping/https://www.sciencedirect.com/topics/agricultural-and-biological-sciences/epitopes
https://www.nature.com/articles/nri724
